Ada yang mengatakan bahwa Rayquaza telah hidup selama ratusan juta tahun. Banyak legenda yang menceritakan tentang bagaimana ia menghentikan bentrokan antara Kyogre dan Groudon.
Pokémon ini terbang secara terus menerus di lapisan ozon dan mengkonsumsi meteoroid sebagai makanannya. Ia dapat melakukan Evolusi Mega dengan menggunakan energi yang berasal dari meteoroid yang dikumpulkan di dalam tubuhnya.
