Dikatakan bahwa Rayquaza telah hidup selama ratusan juta tahun. Tersisa legenda yang isinya Pokémon ini menghentikan perselisihan antara Kyogre dan Groudon.
Rayquaza terus terbang di lapisan ozon dan melahap meteoroid sebagai makanannya. Pokémon ini dapat melakukan Evolusi Mega menggunakan energi yang berasal dari meteoroid yang tertimbun di dalam tubuhnya.
