Hanya kepala utama Hydreigon yang memiliki otak. Walaupun kecerdasannya tinggi, Pokémon ini hanya berpikir untuk menghancurkan segalanya.
Dikatakan bahwa Hydreigon menjadi ganas karena dahulu manusia sangat membenci Pokémon ini sebagai wujud kejahatan sejati dan terus menyerangnya.
