Terapagos tampaknya tertarik dengan gunung yang ada di dekat Kota Blackthorn di Daerah Johto! Menurut Dot, setahun lalu, ada orang yang lapor telah melihat Rayquaza hitam di sana. Liko, Roy, dan Ult bergerak menuju gunung tersebut, namun seorang penduduk lokal memperingatkan mereka tentang Tim Naga Kalap yang dikenal sering mengancam para Pelatih yang masuk ke area tersebut. Ternyata Tim Naga Kalap betul-betul muncul, tapi saat mereka mengancam Liko, Roy, dan Ult, tanpa sengaja mereka keceplosan tentang Rayquaza hitam! Apakah Tim Naga Kalap adalah kunci untuk menemukan Pokémon Legendaris Rayquaza hitam?
